正学书院，原址位于今南昌市西湖区松柏巷和廉让里巷之间的巷内，即今老贡院巷36号内。明嘉靖三十五年(1556)，由江西布政使张元冲与江西提学副使王宗沐在进贤门内旧贡院址（即阳春书院原址）上创建。

阳春书院建于明正德六年（1511），为宁王朱宸濠所建，目的是想网罗文士，谋反朝廷。正德十四年(1519)朱宸濠起兵谋夺帝位，为王守仁所败，然书院犹存。四年后改作贡院。嘉靖元年(1522)曾于此试士，嘉靖二十四年（1545）毁于火。次年（1546）徙贡院于东湖之左。三十五年(1556)布政使张元冲与提学副使王宗沐于阳春书院原址重建书院，改名正学书院。“名以‘正学’者，所以别其学为圣贤不杂于他道”（罗洪先《正学书院记》，见同治《南昌县志》卷六）。建祠祀宋代理学家周敦颐、程颢、程颐三位先贤。广建斋舍，中为崇迪堂、广几轩，后为退食轩、燕休馆，左右为号舍。外为夹道，缭以周垣。庖寝圊福，巨细咸具，“可容生徒数百十人”。罗洪先有记。

万历初张居正禁毁书院，正学书院停办，改为正学祠。张居正死后，书院又复兴起。万历十五年(1587)夏，沈九畴任江西提学副使，下车伊始，即来到正学祠祭祀，看见正学祠仅存屋三间，上漏下湿，周围草木杂乱丛生，不免心生感慨，打算重新恢复书院。于是下文让南昌知府范涞从民间买回地皮，让南昌知县何选、新建知县佘梦鲤负责招集工匠进行重建。在沈九畴的倡导下，正学书院得以恢复。书院居中为正学祠，东西两面布有楹联。在祠的东西两边修整与扩建房舍112间。正学祠东北为道南祠，西北为芳润轩。芳润轩是与诸生谈艺之所。正学祠前建讲经堂5间，堂前有门2重，各有3间，门外题榜曰正学祠。沈九畴有《重建正学书院记》，记中称其规模“壮于旧贯”。

天启间（1621—1627），阉党魏忠贤废毁全国书院，正学书院遭到废毁。

清顺治间（1644—1661）正学书院改为贡院。后移贡院于东湖北，止存故址。

正学书院为官办的江西省会书院。书院由布政使张元冲与江西提学副使王宗沐创建，并得到了巡抚何迁（号吉阳）、巡按徐绅（号五台）、郑本立（号东泉）等人的支持。万历年间重修时，又为提学副使沈九畴倡议，由南昌知府及南昌、新建二县知县负责地皮的回购及修建，并得到巡抚陈有年、庄国桢以及御史孙旬、朱鸿谟、祝太舟的关注。

正学书院的经费来自官府拨款、民间捐赠。书院创建时，就是“取完壤成材，辅以帑币”建成的。重建时又有人自愿将土地赠给官府而不取报酬，建造费用以及廪饩则来自官府拨款。

正学书院属于讲会式书院。其讲会由在职官员倡兴。据记载王门高弟张元冲长期在江西做官，历任江西参政、布政使、副都御史、巡抚等职，政事之暇，与同门邹守益（号东廓）、罗洪先（号念庵）、黄宏纲（号洛村）、万虞恺（号枫潭）诸公“联讲会，以订证文成之学，因辟正学书院于省会，群彦士而修业焉。先生岁时进考，其成喁喁如也。异时名世巨儒，多出其中已”。由此可知，南昌正学书院实为江西省会书院，赣省彦士咸集，联讲会而订良知之学，为一时盛况。此外，巡抚徐栻（号凤竹）亦曾请理学家、教育家、王守仁弟子魏良弼“讲学于正学书院，以式多士。环座听讲者，日数百人”（《水洲文集》）。王门弟子王栋（泰州人）曾主书院讲席。

明代正学书院成为江右王门弟子开讲会以证师学的一个重要场所，在中国书院史上占有一席之地。