钟陵书院位于进贤县钟陵镇，故名钟陵书院。明正德七年(1512)江西提学副使李梦阳建。明正德六年（1511）夏，李梦阳任江西提学副使。上任伊始，便马不停蹄，风尘仆仆到各府县视察学校和书院。李梦阳对书院非常重视，到各府县视察时，命令县官拆毁神庙鬼祠，改建为书院。钟陵书院就是在这一背景下建立的。

    正德七年(1512)，李梦阳准备拆毁进贤县的南岳庙，以改建为书院。福胜寺的僧人得知后，通过李梦阳的学生陈云章转告李梦阳请求以寺易庙，认为“庙僻而寺临衢且近市，寺为书院，则书院、学各据崇相望也，于学便”。这一请求最终得到李梦阳的同意，于是将位于县学之后的福胜寺改建为书院，而将南岳庙改为福胜寺。教谕黄懿、训导谈一凤与陈云章等人与李梦阳商议书院的名称和祭祀的对象，以进贤以前是南昌县钟陵镇，后来割出成立进贤县，故将书院命名为钟陵书院，以周敦颐曾经做过南昌县的县尉，故书院立濂溪祠祭祀周敦颐。书院的面积，方志记载不一。如嘉靖《进贤县志》记载，钟陵书院长13丈，宽37丈。而清康熙、同治《进贤县志》则记载为长12丈，宽20丈。钟陵书院建有坊牌一、濂溪祠、祠前立讲堂，祠左右有明、通、公、溥四斋，还建有东西廊屋，立有光霁亭。不久建昌府推官赵汉恰巧代理知县，对书院进行了修葺。知县王纪到任后，又建二门，立碑。并设立了院租，设置了门卫。李梦阳有记。明嘉靖四十二年（1563）所修的《进贤县志》中提到钟陵书院“今废。拓地重建，无泯学宗濂溪至意，切有望焉。”可见嘉靖末年钟陵书院已废。

    院址先后易地三处。明万历十二年（1584），知县林道楠将书院移建于积善坊大井隘巷，旋圯。万历三十一年（1603）知县黄汝亨又将书院迁到华盖山白马庙故址。这次迁建的原因是“以儒学后脉有华盖山，旧白马庙在焉，庙废。学脉遭居民取土受伤，遂从士请，改钟陵书院于庙址。”（康熙《进贤县志》卷四）天启六年(1626)因魏忠贤废天下书院，知县梁应材将书院改为王公祠。至天启（1621—1627）以后“废为丘墟”（同治《进贤县志》卷十）。清康熙十年(1671)知县聂当世倡捐建于迎恩门内，绅民踊跃筹资。邑人饶宇栻有《改迁钟陵书院记》，记中称“量材鸠工，为门伉如，为堂靓如，为左右两傍各翼如，缭以周垣，涂以丹垩，事不劳而功倍，而钟陵书院壮于旧贯矣。”然而至乾隆十三年（1748）进贤知县向德一建曲水书院时，钟陵书院就已“日久颓坏，仅有其名”（同治《进贤县志》卷十）。同治年间已废。

    书院属官办性质。办学宗旨为“学宗濂溪，效法圣贤，正谊明道，培育人材”。教学内容以经学为主，注重考课。经费主要来自两个方面：一是官府的学田收入，二是民间捐赠。钟陵书院刚建立时，知县王纪就设置了院租，以南岳庙租9石以及庙田作为经费来源。清康熙十年(1671)知县聂当世倡捐建于西门，绅民踊跃筹资。是进贤历史上最早的一所书院，前后延续了300多年，为进贤古代的地方教育作出了贡献。饶宇栻在《改迁钟陵书院记》一文中，对钟陵书院的重建予以肯定，认为不仅使进贤“后学敬业之有所”，而且也是进贤“人才勃兴之一会”。乡人章兆瑞有《聂侯钟陵书院落成》一诗：

吾道由来星日明，有宋濂溪亦绍成。

师哉大雅重嗣响，五百年后堪与京。

光风披拂振枯落，又兼霁月照人清。

鸾旂笩哕来戾止，小大从公弦诵声。

纍纍善政屈群醜，更化况逾十载久。

瞻依祗赖片席留，召棠羊碑同不朽。

忆昔作者空同李，嘘植多士如云起。

钟陵迩者渐榛芜，有德有造从今始。

固知课最玺书迎，曳履直上星辰行。

吾侪跻堂歌思服，稷祀还与元公并。