七月二十八日（农历六月二十三日）清晨，太平军又从原有城墙缺口的西北，用地雷轰塌城墙六、七丈，守城的清兵纷纷逃窜，接着又在缺口的西南轰塌城墙八、九丈。顿时“巨石腾空，尘土四塞”，守城的清军官兵一百多人陷在泥土中，当时正是倾盆大雨，太平军乘势冲到城墙下，发动猛烈进攻。

一个举着黄色军旗、身穿黄马挂的太平军军官首先冲上城来。士兵们每人头上戴一个小盆也跟着争先冒死冲上来。这时，江忠源急忙调集各处守军拚死抵抗，并倒了几十桶火药，纵火焚烧，加上城外各营清军协同夹击太平军后路，危城才算没有攻破。可是守城的清军仅仅是湖北军就死伤了两百多人。

太平军到此，曾经两次用地雷轰塌城墙，都没有攻下南昌城。于是赖汉英和来增援的石祥祯商量，认为“仰攻坚城，兵家所忌”，看来是难以立刻见效，不如先攻城外的清军兵营。这时清军九江总兵马济美刚从北京来南昌，九江兵营驻在永和门外。七月三十一日（农历六月二十六日），天刚刚放晴，赖汉英指挥太平军对九江营发动突然袭击。马济美率清兵一千多人仓皇应战，清兵见势个个胆怯，不敢向前。

在这场战斗中，马济美身中数枪，刺穿胸部，落下马来。清兵失去了统帅，大部溃散。守城的清军也不敢出城接应，仅以大炮掩护而已。马济美的击毙，引起了守城清军当局极大震动，江忠源亲自前往哭吊。这是太平军攻城以来一次重大胜利。这天潮王洲上和各处太平军兵营“欢声动地，钲鼓喧腾，互相庆贺”。热烈地庆祝这次大捷。

十多天来连日大雨，城里、城外积水一片汪洋。太平军趁着这个机会在永和门外坟地到七里街一带构筑营寨，树立木栅，挖掘濠堑。沿江一带整齐地排满了战船，严阵以待。太平军还赶制了几百部云梯，日夜挖掘地道，仍然坚持不懈的准备攻城。

八月五日（农历七月一日），清军组织城外九江、赣州、广东、四川、贵州军队分三路向太平军营寨进攻，城里清军也同时从空心炮台配合出击。这时太平军挥动军旗，吹起螺号，各自坚守营寨，按兵不出。

等到清兵攻击疲劳企图撤退时，太平军跟踪追击，并分头抄袭清军的归路，于是又一次沉重地打击了进犯的清军。清军还同时发动了对章江门外文孝庙的太平军据点的攻击，企图越墙而入的清军全部被歼，从四周进攻文孝庙的清军也受到枪炮火力的迎头痛击。

八月八日（农历七月初四日），太平罕再度发动攻城，用地雷轰塌了章江门附近的城墙七丈多，接着发动猛攻。守城清军也拚死堵击，战斗极为激烈，双方伤亡达一千多人。守敌急忙用沙袋和尸体来堵塞城墙的缺口。这是太平军攻城以来第三次的轰塌城墙。

接连几天在惠民门外，七里街，章江门对岸，太平军和清军均发生了激烈的战斗。这时，赖汉英等认为攻取南昌城，不能仅仅围兵城下，必须同时夺取南昌邻近的州县，以便孤立南昌。于是派曾天养等率领太平军进攻南昌附近县城。八月里，太平军先后攻克了丰城、瑞州、饶州、乐平、景德镇、浮梁等地。